研究方法
这个应用提出了使用HILIC-UHPLC-MS方法进行代谢组学研究,具体来说,
- 色谱柱选择:使用了1.8-μm iHILIC-Fusion UHPLC HILIC柱,填充有电荷调制羟基乙基酰胺硅胶。
- 梯度洗脱:使用以下梯度洗脱程序:
- A) 乙腈/甲醇(98/2,v/v)
- B) 10 mM 氨基甲酸铵与0.1%(v/v)甲酸的超高纯(Milli-Q)水中(pH 3.15)
- MS系统设置:使用Agilent 1290 Infinity UHPLC系统和Agilent 6530 QTOF质谱仪。干燥气温度为250℃,流速为8 L/min;鞘气温度为350℃,流速为11 L/min;雾化器压力为45 psig;毛细管电压为2000 V;碎片器电压为150 V。
- 样品制备:标准溶液以1μg/mL的浓度在60/40(v/v)乙腈/Milli-Q水中制备,用于估计保留时间。选择的代谢物的物理化学范围足够广泛,以保证可靠的(非脂质)代谢组学分离。
实验设计
- 细胞培养:使用HepaRG细胞在12孔板上进行细胞培养。
- 液液萃取:每孔用80%甲醇水溶液刮取细胞,然后使用1/1.5/1甲醇/水/氯仿混合物进行液液萃取。收集极性相并蒸发至干,然后以60/40(v/v)乙腈/Milli-Q水复溶。
- 色谱分离:使用上述HILIC-UHPLC-MS系统进行色谱分离,记录色谱图。
结果分析
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标准品色谱分离:11种标准品的归一化色谱图显示,保留时间随化合物极性增加而增加。值得注意的是,亮氨酸和异亮氨酸(5和6)之间的分离效果显著,因为它们仅在烷烃链上的甲基位置不同,这在其他HILIC柱中通常难以分离。
图1标准品的HILIC-MS色谱分离结果:1)孕酮,2)咖啡因,3)腺嘌呤,4)苯丙氨酸,5)亮氨酸,6)异亮氨酸
,7)丝氨酸,8)酪氨酸,9)叶酸,10)赖氨酸,11)鸟氨酸 -
细胞提取物色谱分离:注入标准品的色谱图证实了细胞提取物的分离效果。相对非极性化合物首先被洗脱;中性极性化合物在3到10分钟之间洗脱;极性碱性化合物在10到15分钟之间洗脱。总之,新开发的方法可以在15分钟的梯度运行中检测到700种分子。
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质量控制:通过重复注入QC样本,评估了色谱图的质量。计算了每个化合物的相对标准偏差(RSD),并评估了整个数据集的RSD。结果显示,iHILIC-Fusion的mRSD为6.7%,70%的变量的RSD低于15%。根据FDA的规定,RSD低于20%被认为是可接受的。因此,当前的HILIC-UHPLC-MS设置提供了一个出色的检测系统,适用于代谢组学研究中极性化合物的分析。
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图3提取特征的代谢组学偏差
总体结论
该论文开发的iHILIC-Fusion柱采用混合分离原理,能够基于其多种物化性质有效分离大量极性代谢物。因此,其同类代谢物的分离效率高于测试中的其他HILIC柱。该方法为代谢组学研究提供了一种高效、可靠的工具。
本文由AI生成,Ruby Cai 审阅修改

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原文下载:Hilic–UHPlc–MS as a Tool for Metabolomics Study
中文翻译下载:以HILIC-UPLC-MS为工具研究代谢组学